HACCP食品中的化学性危害又可分为以下几类：
（１）化学清洗剂。在食品的预处理或加工操作中，化学清洗剂是常见的化学性危害物。清洗剂可能会残留在用具或管道工程的管道和加工机械上，从而污染食品，也可能会在清洗操作过程中飞溅到附近的食品上。
因此在制定HACCP计划时，须注意控制清洗操作过程中的化学性危害。例如：检查已清洗的机械有否清洗剂的残留；或者使用的化学清洗剂，并对清洗程序进行适当的设计和管理。
（２）农作物的药品。
（３）增塑剂和包装材料。
（４）其他化学物质。